Microbiome non bactérien des MICI

Le microbiome intestinal a été impliqué dans la pathogenèse des maladies inflammatoires de l’intestin (MICI).

Ce microbiome intestinal des MICI est moins diversifié que celui de la population non affectée, un phénomène souvent appelé dysbiose. Cependant, ces études se sont fortement concentrées sur les bactéries, tandis que d’autres micro-organismes intestinaux – champignons, protozoaires et bactériophages – ont été négligés. Parmi les microbes non bactériens qui ont été étudiés en relation avec les MICI, la plupart sont considérés comme des agents pathogènes, bien qu’il existe des preuves que certaines de ces espèces peuvent être des commensaux inoffensifs.

Cette revue étudie le microbiome intestinal non bactérien des MICI, en mettant en évidence les biais actuels, les limites et les questions en suspens qui peuvent être résolus avec des méthodes de séquençage de l’ADN à haut débit. Elle souligne l’importance d’étudier les micro-organismes non bactériens aux côtés des bactéries pour une vue complète de l’ensemble du biome des MICI et pour fournir une définition plus précise de la dysbiose chez les patients. Avec la popularité croissante des thérapies modifiant le microbiome pour le traitement des MICI, comme la transplantation de microbiote fécal, il est important que nous comblions ces lacunes dans les connaissances pour assurer un traitement sûr et efficace des patients.