dernière mise à jour le 09/10/2026
Hypothèse hygiéniste
Partant du constat que dans les pays industrialisés, l’hygiène et les antibiotiques se sont accompagnées d’une augmentation de la fréquence des maladies allergiques et auto-immunes, l’hypothèse hygiéniste postule que l’exposition précoce à une grande diversité de microorganismes permet de développer harmonieusement le système immunitaire, alors qu’inversement un environnement très aseptisé conduit à un système immunitaire inadapté augmentant le risque d’allergie ou d’auto-immunité. Les expérimentations animales confirment cette hypothèse.
Cet article Bach de 2002 fait une première synthèse des arguments en faveur de cette hypothèse.
Physiopathologie
Une infection peut provoquer une maladie auto-immune par deux grands mécanismes
Certes La diminution des infections dans les pays industrialisés coïncide avec une hausse des allergies (asthme, rhinite) et des maladies auto-immunes (diabète de type 1, sclérose en plaques, maladie de Crohn, etc.) Mais cela ne suffit pas à démontrer une relation causale unique. Car d’autres facteurs ont évolué simultanément : alimentation, environnement, urbanisation, exposition aux animaux, microbiote intestinal, pollution, changements du mode de vie et facteurs génétiques.
Plusieurs processus physiopathologiques peuvent expliquer ce lien :
Preuves épidémiologiques
Implications cliniques et thérapeutiques
Ces observations ouvrent la voie à des stratégies préventives ou thérapeutiques ciblant le microbiote (probiotiques, thérapies par vers parasites) ou mimant les effets protecteurs des infections (vaccins, immunothérapies).
Conclusion
L’article conclut de façon nuancée : les infections sont certainement un facteur important dans la susceptibilité aux maladies auto-immunes, mais leur effet dépend du microorganisme, du moment de l’exposition, du terrain génétique de l'individu et de la manière dont le système immunitaire répond, mais les infections peuvent aussi, dans certaines cas déclencher directement l’auto-immunité.
Bach JF
The effect of infections on susceptibility to autoimmune and allergic diseases
N Engl J Med. 2002 Sep 19;347(12):911-20
DOI : 10.1056/NEJMra020100
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