Evolution génomique de 2658 cancers

Abstract

 Le cancer se développe par un processus d'évolution somatique. Les données de séquençage d'une seule biopsie représentent un instantané de ce processus qui peut révéler le moment des aberrations génomiques spécifiques et l'influence changeante des processus mutationnels. Ici, par l'analyse du séquençage du génome entier de 2 658 cancers dans le cadre du consortium d'analyse pan-cancer des génomes entiers (PCAWG) de l'International Cancer Genome Consortium (ICGC) et du Cancer Genome Atlas (TCGA), nous reconstruisons le cycle de vie et l'évolution des processus mutationnels et des séquences de mutation motrices de 38 types de cancer. L'oncogenèse précoce est caractérisée par des mutations dans un ensemble restreint de gènes moteurs et des gains spécifiques du nombre de copies, tels que la trisomie 7 dans le glioblastome et l'isochromosome 17q dans le médulloblastome. Le spectre mutationnel change de manière significative tout au long de l'évolution de la tumeur dans 40 % des échantillons. Les stades ultérieurs se caractérisent par une diversification quasi quadruple des gènes moteurs et une instabilité génomique accrue. Les altérations du nombre de copies se produisent souvent lors des crises mitotiques et conduisent à des gains simultanés de segments chromosomiques. Les analyses temporelles suggèrent que les mutations motrices précèdent souvent le diagnostic de plusieurs années, voire de plusieurs décennies. Ensemble, ces résultats déterminent les trajectoires évolutives du cancer et mettent en évidence les possibilités de détection précoce.