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Rôle du microbiote dans la reproduction

dernière mise à jour le 24/01/2025

Introduction

À mesure que les études révèlent l’étendue des microbes associés à la vie humaine, il apparaît des possibilités de les manipuler et d’augmenter leurs fonctions de manière à améliorer la santé et la longévité. Qu’il s’agisse de leur implication dans la reproduction, le développement du fœtus et du nourrisson, ou de lutter contre de nombreuses maladies. Nous suggérons qu’une grande partie du dogme médical est sur le point de changer de manière significative grâce à la reconnaissance et à la compréhension de ces interactions microbes-hôte jusqu’ici méconnues.

La plupart des travaux sur le microbiome se concentrent sur les maladies intestinales chroniques plutôt que sur l’appareil reproducteur féminin. Dans certains cas, les comités d’éthique découragent les recherches sur les femmes enceintes de peur d’endommager le fœtus. Cette revue fait le point actuel.

La reproduction est parsemée de processus complexes, dont chacun peut être problématique, voire catastrophique pour le fœtus ou la mère. La conception commence lorsque le sperme entre en contact avec l’ovule. Jusqu’à récemment, on pensait que le site de conception et de croissance du fœtus (les trompes de Fallope et l’utérus) et tout l’environnement du fœtus étaient stériles et que le bébé n’était exposé aux micro-organismes qu’à la naissance. Ainsi, les microbes n’étaient pertinents que pour les infections qui avaient un impact sur la fertilité ou la réussite de la gestation.

 

Microbes et conception

Parmi les cas d’infertilité, un tiers restent inexpliqués, tandis que les autres sont attribués à une infection ou à des problèmes anatomiques et physiologiques. Certaines études examinant ces cas ont montré la présence de lactobacilles dans le liquide folliculaire humain. Ces bactéries, connues pour leurs effets bénéfiques sur la santé et leur utilisation dans l’alimentation, ont récemment été associées à la maturation et au transfert d’embryons.  

De nombreux types de bactéries probablement présentes dans le col de l’utérus et le vagin ne sont pas faciles à cultiver. En conséquence, l’efficacité des traitements contre les infections vaginales est souvent faible. Le microbiote normal ne se rétablit pas rapidement après l’utilisation d’antibiotiques, et donc si les lactobacilles sont importants pour la FIV, un traitement antibiotique peut en empêcher le succès.

La présence de lactobacilles signalée dans les ovaires est en elle-même intéressante, en particulier parce qu'une étude antérieure n'a pas réussi à trouver de bactéries cultivables dans le tissu ovarien, et parce que l'endomètre est protégé par des barrières physiques, des peptides antimicrobiens, du complément, des récepteurs de type Toll (TLR) et d'autres récepteurs de reconnaissance de formes. Il semble raisonnable de soutenir que les lactobacilles auraient pu monter du vagin et du col de l'utérus jusqu’aux trompes de Fallope.

L'ovaire est bien protégé, avec des protéines telles que la pentraxine 3 (PTX3), produites par les cellules de l'immunité innée en réponse aux signaux pro-inflammatoires et à l'engagement des récepteurs de type Toll. Cette protéine reconnaît les microbes, active le complément, facilitant la reconnaissance des phagocytes, et elle est également essentielle à la fertilité féminine. Bien que ni cette protéine ni aucune autre protéine « protectrice » n'aient été étudiées dans le liquide folliculaire humain contenant des lactobacilles, le fait que les bactéries soient apparemment viables et que la femme reste fertile suggère que les microorganismes sont dans un état de quiescence, sont tolérés par l'hôte ou sont quelque peu actifs métaboliquement et remplissent une fonction importante encore inconnue. Bien que le liquide contienne du lysozyme, une enzyme qui peut être bactéricide pour les bactéries Gram-positives, il n'a pas tué les lactobacilles. De plus, l'ovaire contient des cellules épithéliales et le liquide folliculaire lui-même contient près de 500 protéines, diverses hormones, dont des œstrogènes, des acides gras, et a probablement une teneur en nutriments suffisante pour que les bactéries se développent. Il semble peu probable que les lactobacilles ou d’autres organismes se multiplient rapidement ou soient présents en grand nombre, mais ils sont probablement présents en faible nombre, comme dans le microbiote du sein. Les lactobacilles peuvent maintenir une activité estérase, une membrane cytoplasmique intacte et un gradient de pH.

Le syndrome des ovaires polykystiques (SOPK) est un trouble endocrinien hétérogène qui augmente le risque de développer un diabète sucré de type 2 et une maladie cardiovasculaire. Une étude portant sur 217 femmes atteintes du SOPK et 48 femmes en bonne santé comme témoins a démontré des taux élevés de lactate, d'acides gras à longue chaîne, de triglycérides et de lipoprotéines de très faible densité dans le plasma, tandis que les concentrations de glucose, de phosphatidylcholine et de lipoprotéines de haute densité étaient réduites chez les patientes atteintes du SOPK. 18 Les taux d'alanine, de valine, de sérine, de thréonine, d'ornithine, de phénylalanine, de tyrosine et de tryptophane ont également augmenté de manière générale, tandis que la glycine et la proline ont été considérablement réduites dans les échantillons de SOPK. Les changements alimentaires, tels que la réduction de l'apport en glucides, affectent l'insuline et peuvent améliorer les résultats reproductifs/endocriniens. Des processus tels que la bêta-oxydation des acides gras médiée par la l -carnitine ont un rôle bien établi dans l'approvisionnement énergétique des ovocytes et des embryons, et protègent également les cellules bactériennes des dommages dus aux radicaux libres. Le nombre de bactéries présentes dans l'environnement ovarien est vraisemblablement faible et on ne sait pas si elles sont suffisantes pour induire des changements métabolomiques mesurables. Cependant, il s'agit d'un aspect qui mérite d'être approfondi étant donné les propriétés fermentatives métaboliques des lactobacilles.

Bien que nous ne puissions que spéculer sur les fonctions que les lactobacilles pourraient remplir dans l'ovaire sain ou le liquide folliculaire, d'autres études suggèrent un rôle des lactobacilles dans la conception. Une étude a révélé que les lactobacilles peuvent protéger les spermatozoïdes humains des espèces d'oxygène radicalaire en présence de troubles vaginaux, améliorant ainsi le potentiel de fécondation de l'hôte femelle. La vaginose bactérienne (VB) est le trouble vaginal le plus répandu, et elle est associée non seulement à un taux accru d'accouchement prématuré, mais aussi à une capacité réduite à concevoir. Dans une étude portant sur 874 femmes atteintes d'infertilité féminine et 382 femmes fertiles asymptomatiques, la prévalence de la VB était significativement plus élevée chez les premières (45,5 % contre 15,4 %), et la prévalence la plus élevée était observée chez les patientes atteintes du SOPK (60,1 %) et d'infertilité inexpliquée (37,4 %). Mais certains ne sont pas d'accord pour dire que la VB affecte l'accouchement prématuré. Une étude longitudinale n’a trouvé aucune différence dans les taxons bactériens, l’abondance relative et la fréquence des types d’états communautaires entre les femmes qui ont accouché à terme et celles qui ont eu un accouchement prématuré spontané. L’incapacité du traitement de la vaginose bactérienne au métronidazole à modifier les taux d’accouchement prématuré, appuierait ce dernier point de vue, mais l’efficacité de la clindamycine va à l’encontre de cette hypothèse. Le fait que le traitement de la vaginose bactérienne ait considérablement amélioré le taux de grossesse suggère que les bactéries peuvent jouer un rôle dans la conception et la réussite de la grossesse. De toute évidence, d’autres études sont nécessaires pour confirmer ce concept et comprendre les mécanismes, en particulier le rôle des lactobacilles dans le liquide folliculaire. Les études d’intervention qui évalueraient l’impact des lactobacilles probiotiques sur la fertilité et la conception seraient également très valables et constitueraient probablement une meilleure approche que les antibiotiques.

 

Développement fœtal et durée de la grossesse

Une étude signalant la présence de bactéries dans les membranes fœtales prématurées et à terme est intéressante pour deux raisons : (i) elle confirme qu’il existe une plus grande propagation et diversité d’espèces bactériennes dans les tissus des femmes qui ont accouché très prématurément ; et (ii) elle montre que des bactéries peuvent être présentes sans complications apparentes. Un rapport récent selon lequel le fœtus des femmes en bonne santé est effectivement exposé aux bactéries via le placenta, soulève de nombreuses questions. Les études étudiant le microbiote placentaire sont encore rares et on en ignore la signification en termes d’évolution. Ce qui est certain est que l’abondance et la diversité des taxons dépassent ce qui était attendu.

On a aussi découvert que la translocation bactérienne de l'intestin vers les ganglions lymphatiques mésentériques et la glande mammaire se produisait en fin de grossesse et pendant la lactation chez la souris. Pendant une telle période, les cellules du lait maternel humain et les cellules mononucléaires du sang périphérique maternel contiennent des bactéries viables. Ce mécanisme pourrait également expliquer la présence de bactéries dans le liquide amniotique obtenu à partir de souris saines.

Il est facile d’affirmer que le but de ce transfert bactérien prénatal potentiel est de préparer le fœtus à entrer dans un monde microbien, mais le prouver est difficile.

Il est évident que les souris axéniques se reproduisent, donc on peut soutenir que les microbes ne sont pas essentiels à la conception et à la grossesse. Cependant, ils peuvent jouer un rôle clé dans une reproduction physiologique car il est également vrai que les animaux sans germes présentent des défauts prononcés dans de multiples aspects de la structure et de la fonction de leurs organes, conduisant souvent à des troubles digestifs et reproductifs. De plus, les animaux sans germes contiennent non seulement un nombre anormal de plusieurs types de cellules immunitaires et de produits de cellules immunitaires, mais présentent également des déficits pertinents dans les structures lymphoïdes locales et systémiques, y compris des plaques de Peyer hypoplasiques et un nombre réduit de follicules lymphoïdes isolés. Par conséquent, tout système de transmission bactérienne verticale impliquant des processus complexes de communication croisée avec les cellules immunitaires sera altéré chez ces animaux.

Bien que les animaux axéniques soient un outil de recherche formidable et aient grandement contribué aux recherches sur le microbiote, leur utilisation présente des inconvénients majeurs. Il a été déclaré que le microbiote intestinal étant crucial pour le bon développement de l'hôte, les réponses modifiées présentées par les animaux axéniques pourraient ne pas refléter ce qui se passe réellement dans le milieu naturel. Par conséquent, il peut être difficile de transférer les résultats obtenus dans un système sans germes aux mêmes événements se produisant chez un hôte conventionnel. 41 En fait, l'ajout ultérieur de bactéries aux animaux axéniques après la naissance influence le développement immunitaire, améliore la sociabilité et réduit l'anxiété, soulignant l'importance des microbes.

Même si les études de confirmation utilisant du matériel chirurgical et des procédés de manipulation stérilisés et sans ADN sont les bienvenues, la probabilité que des bactéries soient présentes dans le placenta est alléchante et favorise le concept d’une symbiose microbiome-humain tout au long de la conception et de la gestation. Le large éventail de microbiotes non pathogènes des phylums Firmicutes, Tenericutes, Proteobacteria, Bacteroidetes et Fusobacteria suggère fortement que ce microbiote n’est pas un contaminant mineur.

En termes de développement fœtal, la présence d’ADN de Bifidobacterium spp. et de Lactobacillus rhamnosus dans 34 placentas humains (25 accouchements vaginaux et neuf accouchements par césarienne) a suggéré au moins la possibilité d’un certain degré de signalisation microbienne mère-fœtus. D’autres études, bien que réalisées sur des souris, ont montré que lorsque le microbiote intestinal de la mère change, l’inflammation et la perte d’énergie, l’adiposité et l’insensibilité à l’insuline peuvent également changer, affectant à leur tour le fœtus. 

Comme indiqué précédemment, des pathologies comme la vaginose bactérienne peuvent influencer la durée de la grossesse. Cependant, la présence de virus est potentiellement encore plus importante. Bien que peu d’études sur le virome aient été réalisées sur l’appareil reproducteur féminin, une série d’études a clairement montré qu’une infection virale du placenta ou de l’amnios prédisposait à un travail prématuré. L’infection virale pourrait altérer le mécanisme normal de médiation de l’interaction entre le placenta/les tissus maternels et le microbiote normal présent au site d’implantation. Ces changements induiraient très probablement des dommages aux couches protectrices permettant un accès bactérien supplémentaire. Cependant, étant donné la prévalence élevée de certains virus chez l’homme, par exemple une population raisonnablement stable d’environ 1200 génotypes viraux dans l’intestin humain, 52 on pourrait supposer que les virus peuvent également donner accès aux lactobacilles ou aux bifidobactéries sans endommager ultérieurement la membrane ni provoquer de fausse couche. Cela mérite d’être étudié.

Il a été suggéré que les rétrovirus endogènes interviennent dans l’évolution régulatrice et qu’il s’agit d’un mécanisme important sous-jacent à l’évolution du développement placentaire. On suggère que les rétrovirus se sont intégrés dans le génome des cellules germinales et que l’activité virale est responsable de l’établissement du type de cellule trophoblastique ancestral par le biais du recrutement régulateur des gènes du développement. Si cela est vrai, une telle association hôte-virus est intrigante. L’une des implications est que les aberrations épigénétiques pourraient causer une répression rétrovirale endogène globale et des anomalies placentaires, telles que la pré-éclampsie. À tout le moins, cette association virus-hôte illustrerait le rôle central des microbes dans la reproduction.

D’autres effets viraux pathogènes peuvent survenir pendant la grossesse, les troubles du deuxième trimestre dus à l’infection grippale étant liés à une contribution neurodéveloppementale au trouble affectif majeur, en particulier au trouble dépressif unipolaire et à la schizophrénie plus tard dans la vie. Cela illustre davantage la capacité des microbes à influencer la vie, mais compte tenu de la prévalence de l’infection grippale, cela suggère également que des effets protecteurs sont en place dans de nombreux cas pour prévenir cette maladie grave.

Les lymphocytes T et potentiellement les lymphocytes B sont étudiés depuis longtemps en immunologie de la reproduction, notamment en termes de mécanismes de tolérance favorisant le bien-être du fœtus. Ce sujet a été bien étudié ailleurs, mais les cellules immunitaires peuvent-elles préparer le nouveau-né à « recevoir » et à tolérer certains micro-organismes, et si oui, la programmation maternelle pourrait-elle être modulée pour optimiser la réceptivité à certains types microbiens ? Ces questions restent sans réponse, mais des preuves émergentes suggèrent que les microbes peuvent effectivement affecter le développement du fœtus. Les vaccins viraux administrés à la mère, par exemple contre le cytomégalovirus (CMV) et le virus du papillome humain, pourraient-ils affecter la réponse du nouveau-né à certains organismes ? Il existe au moins une étude dans laquelle des cerveaux fœtaux humains infectés par le CMV ont montré un tropisme plus élevé pour les cellules souches/cellules gliales radiales. De toute évidence, les infections par divers organismes in utero peuvent affecter le développement du fœtus et les résultats à court et à long terme pour le nouveau-né, mais certains organismes non pathogènes pourraient-ils faire de même d'une manière qui profite au fœtus ?

Les vitamines sont essentielles pendant les 1000 premiers jours de la vie, notamment l’acide folique pour le développement du cerveau et du système nerveux. Un certain nombre de ces vitamines peuvent être produites par des bactéries. Les processus qui impliquent la méthionine et le métabolisme d’un carbone en réponse à des influences physiologiques, nutritionnelles et hormonales sont essentiels au fonctionnement cellulaire et organique, ainsi qu’à la croissance du fœtus. En effet, les acides aminés (lysine et méthionine), les acides aminés fonctionnels (histidine et ornithine) et un dipeptide ( l -alanyl- l -glutamine) essentiels au développement peuvent tous être produits par des bactéries. La disponibilité des nutriments influence le nombre total de bactéries et la composition des espèces dans l’intestin, mais à ce jour, aucun nutriment ou prébiotique spécifique n’a été examiné pour stimuler la production microbienne de composés essentiels au fœtus. Certaines étapes du développement peuvent être si importantes que même les interventions nutritionnelles après la naissance pourraient être trop tardives. La malnutrition sévère a été associée à un microbiote significativement moins diversifié qui n’est que partiellement amélioré après des interventions nutritionnelles pendant la petite enfance. Il est déjà connu que la diminution de la diversité microbienne au cours de la petite enfance et la colonisation par des bactéries pathogènes spécifiques sont liées à un risque élevé d’allergie, et l’intervention probiotique chez la mère et le nouveau-né peut améliorer ce risque.

La supplémentation en acide folique pendant la grossesse est venue de la reconnaissance de son importance dans le développement du fœtus. Cependant, d'autres composés pourraient être intéressants à prendre en compte, en particulier l'acide linoléique, étant donné que le cerveau est composé à 60 % de matières grasses. La corrélation entre une consommation maternelle plus faible d'acide linoléique et les troubles du spectre autistique, et des niveaux plus faibles d'acide linoléique et la maladie d'Alzheimer plus tard dans la vie, montre l'importance de ces acides gras. La capacité des bifidobactéries et des lactobacilles à produire des acides linoléiques soulève la question de savoir si l'administration de ces souches comme probiotiques pourrait améliorer le développement du cerveau au cours des deux premiers trimestres et au-delà. Les produits chimiques environnementaux, les médicaments et les déséquilibres nutritionnels maternels peuvent interférer avec les voies de régulation impliquées dans le développement cardiaque au début de la gestation. Aucune étude n'a examiné l'intervention probiotique à ce stade de la vie, mais la capacité des lactobacilles à moduler la modélisation cardiaque et à contrer les toxines environnementales mérite des études supplémentaires.

 

Apprendre de la mammite

L’importance du lait maternel dans le développement du nouveau-né est incontestable. En plus des anticorps, des oligosaccharides et des nutriments, le nouveau-né reçoit également des microbes dans le lait. On a longtemps supposé que ceux-ci comprenaient des « contaminants » cutanés de la mère, ou que le bébé avait transmis des organismes qu’il avait acquis à la naissance dans les canaux mammaires lors de l’allaitement. Cependant, des études récentes ont suggéré que les bactéries sont captées par les cellules dendritiques dans l’intestin maternel et transférées dans les canaux mammaires – peut-être comme moyen de coloniser le nouveau-né par l’allaitement. Bien que cette théorie soit encore quelque peu controversée, un Lactobacillus salivarius CECT 5713, isolé du lait maternel et des selles du nouveau-né, a été séquencé et a montré qu’il avait le potentiel de stimuler la maturation des cellules dendritiques immatures et d’inhiber l’ infectiosité in vitro du VIH-1. Ce dernier pourrait potentiellement être important pour réduire l’infection par le VIH chez les nouveau-nés, une caractéristique rapportée dans les lactobacilles vaginaux. Une autre possibilité, non encore étudiée, est que les bactéries atteignent la glande mammaire par adsorption à travers la surface de la peau directement dans le tissu adipeux ou via la circulation sanguine. 

Le dernier exemple cite des travaux sur Staphyococcus aureus , mieux connu pour sa capacité à provoquer des bactériémies, des infections de plaies et des mastites. Plus d'un tiers des femmes peuvent souffrir de mastite, ce qui entraîne l'arrêt de l'allaitement, l'administration d'antibiotiques et d'antalgiques. On la définit en fait comme une « inflammation du sein », mais elle est invariablement associée à une infection bactérienne. Il est intéressant de noter que les changements inflammatoires du sein peuvent aller de processus bénins auto-limités tels que la mastite puerpérale, à un carcinome inflammatoire malin très agressif. Le diagnostic de mastite est généralement posé par des patients présentant une sensibilité focale dans un sein accompagnée de fièvre et de malaise. Le concept d'utilisation de lactobacilles probiotiques pour prévenir et aider à traiter la mastite est à l'étude, mais les données issues de la gestion de la maladie chez les vaches suggèrent que les bactériocines, protéines antibactériennes, pourraient être utiles.

La mammite bovine est un problème majeur auquel est confrontée l'industrie laitière. Plus de 137 organismes différents ont été identifiés comme en étant les agents responsables, notamment des bactéries, des virus, des mycoplasmes, des levures et des algues.  Cela rend difficile un traitement généralisé, mais comme la plupart des cas, au moins au Royaume-Uni et en Irlande, sont causés par Escherichia coli , S. aureus , Streptococcus uberis , Strepococcus dysgalactiae et Streptococcus agalactiae , la thérapie à la bactériocine pourrait avoir un impact significatif. Dans une série d'études, une bactériocine à large spectre produite par le Lactococcus lactis de qualité alimentaire , la Lacticin e3147, qui est bactéricide contre les streptocoques et les staphylocoques in vitro , s'est avérée prévenir de manière significative la mammite lorsqu'elle est appliquée avec un joint de trayon. D’autres études ont montré une incidence réduite de mammite après une exposition expérimentale à S. dysgalactiae et S. aureus . D’un point de vue mécaniste, la perfusion de Lactococcus lactis vivant a entraîné une réponse immunitaire innée rapide et considérable qui peut également faire partie de l’efficacité. Compte tenu des échecs de l’antibiothérapie, cette intervention fournit une illustration du pouvoir potentiel des microbes. De telles applications aux humains méritent certainement d’être tentées, en particulier compte tenu de la possibilité d’administration locale ainsi que par ingestion et modulation immunologique. En fait, une préparation de nisine, une autre bactériocine lactococcique, a été utilisée avec succès pour le traitement de la mammite staphylococcique humaine et des crevasses des mamelons pendant la lactation. 

La capacité des microbes naturels à traiter les infections nous permet de revisiter l’ère pré-antibiotique. On sait que certaines infections se résolvent naturellement, et la compétition des microbes commensaux a été suggérée comme l’un des mécanismes. La population bactérienne dense et complexe qui existe dans le côlon humain pourrait sans doute offrir une richesse de nouveaux antimicrobiens, y compris des bactériocines ainsi que des souches probiotiques candidates. Récemment, des auteurs ont trouvé une nouvelle substance de type bactériocine contre Bacillus subtilis qui est formée par Roseburia faecis , une espèce abondante dans le côlon humain. La découverte d’une variation géographique substantielle dans la composition et la distribution des espèces bactériennes dans les échantillons coliques et vaginaux humains suggère qu’il est intéressant de rechercher dans des échantillons humains collectés dans divers pays et ethnies de nouvelles bactéries productrices de bactériocines et de nouveaux probiotiques candidats. Pour les peuples autochtones, comme les Hadza de Tanzanie, une association plus étroite avec le monde microbien et leur mode de vie de chasseurs-cueilleurs façonnent certainement leur microbiome, et modifie probablement la façon dont ils préviennent, traitent et guérissent des infections, voire en meurent. Chez les Hadza vénézuéliens, les maladies infectieuses sont une cause majeure de mortalité, mais chez ceux qui vivent relativement longtemps, il serait intéressant d’examiner comment leur microbiome a évolué sans vaccination ni médecine moderne. 

 

Conclusions

Il ne fait aucun doute que les micro-organismes jouent un rôle essentiel dans la vie et la longévité humaines. Si les décès dus à des microbes pathogènes sont bien documentés, des études récentes indiquent que les organismes commensaux et, dans certains cas, les probiotiques administrés, contribuent à retarder la morbidité et la mortalité et jouent un rôle essentiel dans la continuité de la vie humaine. Plus nous en saurons sur nos minuscules cohabitants, mieux nous serons en mesure de les manipuler et de les utiliser à notre avantage.

Les microbes sont identifiés dans toutes les régions du corps humain, depuis les sites externes, y compris les sites où les bactéries sont en grand nombre, comme la cavité buccale, le tube digestif, la peau, la région urogénitale et le lait maternel, jusqu'aux sites internes auparavant considérés comme stériles, comme en faible nombre dans le cerveau, le sein et le placenta/fœtus. L'origine des microbes atteignant les sites intérieurs comprend la nourriture, l'eau, l'air, la peau, l'environnement et les personnes. Ces microbes jouent un rôle dans la reproduction, une gestation saine et la longévité d'une manière qui est maintenant découverte.

L’étude de la transmission maternelle interne des microbes chez les mammifères en est à ses balbutiements en raison de l’influence persistante du paradigme de l’utérus stérile et des difficultés éthiques et techniques liées à la collecte d’échantillons de grossesses saines avant la naissance. Ainsi, nous en savons encore très peu sur le nombre et l’identité des microbes qui traversent le placenta, sur leur persistance chez le nourrisson ou sur les conséquences à long terme de leur présence sur la santé. La capacité des bactéries probiotiques, administrées aux femmes enceintes, à moduler l’expression des gènes immunitaires intestinaux du fœtus et la physiologie placentaire suggère que des interactions hôte-microbe ont lieu à cet endroit. Alors que la transmission maternelle des microbes chez les espèces vertébrées n’a été reconnue que ces dernières années, près d’un siècle de recherche est disponible sur la transmission verticale des symbiotes chez les invertébrés. L’apport maternel de microbes à la progéniture en développement est très répandu dans le monde des métazoaires, avec des preuves de transmission microbienne interne dans des embranchements animaux aussi divers que les Porifera, les Cnidaires, les Mollusques, les Plathelminthes, les Nématodes, les Arthropodes et les Chordés. La présence de la transmission maternelle à la base du règne animal et la plasticité surprenante par laquelle les microbes accèdent aux cellules germinales ou aux embryons dans ces systèmes signifient que la transmission symbiotique maternelle est un mécanisme ancien et évolutif avantageux qui est inhérent aux animaux. Par conséquent, nous ne pouvons plus ignorer le fait que l’exposition aux microbes dans l’utérus est plus courante qu’on ne le pensait auparavant et peut même faire partie intégrante de la grossesse humaine en tant que première inoculation de microbes bénéfiques à un enfant à naître.

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Médecine évolutionniste (ou darwinienne)

Depuis quelques années, le problème de l'antibiorésistance, les progrès de la génomique, la redécouverte du microbiote et la prise en charge de maladies au long cours, nécessitent l'introduction d'une pensée évolutionniste dans la réflexion clinique

Le premier diplôme universitaire intitulé "Biologie de l'évolution et médecine" a été mis en place à la faculté de Lyon en 2016.

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