Origine géographique de l'antibiorésistance

La « phylogéographie» peut être définie comme une branche de la phylogénétique qui tente de retracer l’origine géographique des mutations au cours du processus évolutif d’une espèce donnée.

Cette science fondamentale de haut niveau peut avoir des retombées médicales.

Un exemple en est donné dans un article de Science au sujet des staphylocoques résistants à la méthicilline dont on sait qu’ils sont responsables de milliers de morts chaque année.

Harris et ses collaborateurs ont analysé les génomes de ces staphylocoques en essayant de trouver les différences d’un hôpital à l’autre. La méthode utilisée a consisté à étudier le polymorphisme d’une séquence nucléotidique (ST239) connue pour être à l’origine des mutations provoquant la résistance. Elle a permis de découvrir que la ST239 serait apparue en 1960 en Europe.

Ensuite, le taux d’apparition de cette mutation dans divers pays a pu être significativement corrélé au niveau d’utilisation des antibiotiques dans chacun de ces pays.

On peut espérer que l’amélioration des techniques de séquençage et la baisse de leur coût permettront bientôt de mieux comprendre les causes d’apparition de résistance aux antibiotiques, ainsi que les mécanismes d’augmentation de virulence.